文献管理神器，你造吗?Endnote，知道这些才算够!您可根据自己需求选择使用~
1.EndNote
EndNote的功能强大自不必说。强大到何种程度，几乎没有它不能解决的问题，即使某些变态的极其复杂的引文和输出格式，也能轻松应对。
除此之外，EndNote的强大之处还在于其自定义特性，通过自定义EndNote的输出格式，滤件和连接论文件。
但是EndNote也有很多不足，比如分组只支持二级目录，EndNote也不支持标签。相比之下的Zotero这方面就强大的多，可以支持多级分类目录，还可以为文献打标签。
其实这也都不是事儿，主要的是EndNote是商业软件，对于普通个人用户，太贵了。不过EndNote厚道之处在于没有验证机制，只要有授权文件就能用，而且网上的授权文件一找就能找到。著名的应该是同济大学的授权文件了，真是造福了不少穷学生。
顺便说一句，以前的Reference Manager和ProCite这两个文献管理软件现在也被EndNote收购了。
EndNote 相关资源
EndNote 官网
http://www.endnote.com/
Output Styles 下载
http://endnote.com/downloads/dla/styles.zip
Import filters 下载
http://endnote.com/downloads/dla/filters.zip
Connection files 下载
http://endnote.com/downloads/dla/connections.zip
Writing templates 下载
http://endnote.com/downloads/dla/templates.zip
EndNote 中文帮助https://www.howsci.com/endnote/
2.NoteExpress
NoteExpress是一个国产文献管理软件，据说对中文文献和中文数据库的支持比EndNote好。在国内也有不少用户，不过这个软件是商业软件，学生版198，永久版需要 698 元。
但是有这钱我就用Zotero，因此对NoteExpress 一直不感冒。网上也有破解版的，但是也没有尝试过。顺便说一句，尽量不要使用破解版的软件。(传送门：国产文献管理软件 Noteexpress 全使用指南)
NoteExpress 相关资源
NoteExpress官网
http://www.inoteexpress.com/
NoteExpress购买
http://www.inoteexpress.com/CompanyWeb/cartstart.do
3.Mendeley
Mendeley功能非常强大，总起来说Mendeley有以下特点。(传送门：Mendeley——参考文献管理进入2.0时代)
免费，这个比较重要。
支持多平台。迄今Mendeley有网页版，Windows版，Mac版，Linux版，甚至还有iPhone，iPad，iPod版。
支持Microsoft Word, LibreOffice, and LaTeX等软件。
支持PDF标记。可以直接在PDF文档中做相应的标记和注释，这样文章重点部分就可以重点突出了，下次再看时就知道重点和难点了。
支持从其它参考文献管理软件导入文献，现在支持EndNote, Papers 和 Zotero。
可以组织管理文献，通过文件夹的形式把文献分类，管理起来文献简单明了。
可以和同事们分享文献，甚至注释和标记也可以分享。这样大家协作起来更方便。
支持网络备份，而且多个平台之间支持同步。
支持PDF文件导入并自动提取文章信息，支持自动导入特定文件夹内的文献。
强大的搜索功能，可以搜索PDF全文。
强大的社区功能。这才是Mendeley的精髓所在。现在新兴的文献评价标准Altmetric参考因素之一就包括Mendeley的社区功能，如利用Plum Metrics评价系统了解论文的关注度分享情况。
ResearchGate科研人员自己的FaceBook其中一项指标也包括Mendeley的社区。
Mendeley 相关资源
Mendeley 官网
https://www.mendeley.com/dashboard/
Mendeley for Windows
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/windows/instructions/
Mendeley for Mac OS X 10.6+
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/mac/instructions/
Mendeley Desktop for Linux
https://www.mendeley.com/download-mendeley-desktop/linux/
Mendeley for iPhone, iPod Touch and iPad
https://itunes.apple.com/gb/app/mendeley-reference-manager/id380669300
4.Zotero
Zotero是一个开放源代码的文献管理软件。Zotero特色之处是可以作为浏览器插件进行使用。本地的Zotero的文献数据库还可以免费上传到Zotero的网络服务器上，并且不受空间大小限制。但是本地的Zotero的附件，在网络服务器上有大小限制，Zotero的网络服务器仅为每用户提供300M免费存储容量。
Zotero和EndNote也曾干过仗，2008年, 汤森路透起诉 Zotero 侵犯了EndNote的终用户许可协议 (EULA)，逆向工程了EndNote，提供了Zotero把EndNote私有的 .ens风格转换为Citation Style Language风格。
Zotero相比于EndNote，免费不用说，特色是无限级的目录分类，一个目录下可以分为多个子目录。这样管理起来文献就方便多了，而EndNote只支持二级目录。
Zotero还支持文献的标签功能。为每个文献自动打上标签，当然用户也可以自定义标签，这又增加了文献管理功能。
不过Zotero的插入引文和参考文献相比于EndNote来就弱了许多，支持的输出格式也相对有效，只是支持几个大类的输出格式，并没有具体的杂志格式。可能我的理解有错误，但是至少现在我还没找到修改或者添加引文格式的方法。
Zotero 相关资源
Zotero官网
https://www.zotero.org
Zotero for Windows
https://download.zotero.org/standalone/4.0.28/Zotero-4.0.28_setup.exe
Zotero for Chrome
https://chrome.google.com/webstore/detail/ekhagklcjbdpajgpjgmbionohlpdbjgc
Zotero for Firefox
https://download.zotero.org/extension/zotero-4.0.28.3.xpi
Zotero for Safari
https://download.zotero.org/connector/safari/Zotero_Connector-4.0.21-1.safariextz
5.JabRef
JabRef是一个开放源代码、处理BibTeX格式的文献管理软件，提供了简易操作的界面来编辑BibTeX档案。 功能包含从网络上的科学数据库汇入资料，以及整理和搜寻BibTeX档案等。
JabRef的发布遵循GNU通用公共授权条款。软件则是用Java作编程，可以使用于各种操作系统，如Windows、Linux、Mac OS X。
JabRef版本发布于2003年11月29日。其名称JabRef代表着Java、Alver、Batada、Reference。其中Alver 和Batada分别为Morten O. Alver 和 Nizar Batada，两位开发者。
或许只有使用LaTeX撰写科技论文的研究人员才能完全领略到JabRef的妙不可言。虽然对Word写作平台上BibTeX4Word插件的开发和便利应用，使用Word撰写文章且用JabRef推送参考文献同样令人十分愉悦，我并不推荐大家使用。如果有JAVA发烧友，有了它，人生都完美了(所有的都可以关联的感觉爽爆了)。
JabRef 相关资源
JabRef官网
http://jabref.sourceforge.net/
JabRef新稳定版下载
http://sourceforge.net/projects/jabref/files/jabref/2.10/
6.医学文献王
医学文献王是医脉通出品的一个文献管理软件。说起医脉通可能知道的人不是很多，但是要是说起《新编全医药大词典》那在几年前在医学科研人员和学生中那可真是无人不知，无人不晓啊。
医学文献王就是医脉通，不过以前叫金叶天盛。医学文献分为标准版和专业版两个版本，标准版具有软件的核心功能，只要是医脉通用户均可免费使用。专业版授权软件的全部功能，标准版输入激活码后即可激活为专业版，专业版 280 元。
医学文献王相关资源
医学文献王官网
http://refer.medlive.cn/
标准版和专业版功能比较http://refer.medlive.cn/templates/major.tpl.php
暂且就先列举这些吧，虽然未难全部，但是也能供大家做个选择了。基本上这些就是主流的文献管理软件了，如果你能够用好其中一个，基本上就能够解决让人头疼的文献问题了。
7.投稿也能自动化：E-learning
E-learning是知网推出的一款免费软件，基于Word的写作功能，文献管理与NoteExpress、Endnote相似，支持CAJ、KDH、NH、PDF、TEB，以及WORD、PPT、EXCEL、TXT等格式，并将自动转化为PDF文件进行管理和阅读。E-Learning提供了各种辅助工具，撰写论文时，可以直接引用笔记中的内容，并自动生成笔记来源的参考文献;提供数千种期刊模板，可以直接打开预投稿期刊的模板进行论文撰写，并帮助作者解决批量参考文献格式修改困难的问题;支持多种中外文期刊的在线投稿，撰写论文后，可快速进入该期刊的作者投稿系统进行论文投稿。
优点：自动转化、自动生成、自动联络
8.共享神器：Onenote
One Note功能强大，据说很多人买surface就是由于中意它!一般都对Office的Word, Excel ,Powerpoint耳熟能详并且还熟练掌握，却没注意其实它还有一个很实用的工具——One Note! 它凭借office的强大编辑能力，基本涵盖了所有你能想到的和想不到的功能。新出的插件还同时涵盖了思维导图的功能oneNote另一强大的优势是团队协作(多人可共同编辑一份OneNote)及资源共享(其实Office Online中Word，Excel，PPT，Sway等也能实现协作功能)。你还可以在Office 在线网页上编辑。
优点：功能强大
缺点：系统内存的占用比较大(内存小的话就很容易卡机)。OneNote的扩展功能也是要收费的。
9.Biblioscape
与Endnote相比，Biblioscape似乎是专业的(个人观点)。它不仅有看都看不过来的各种条目，甚至有个Web Server可以把文献目录在网上发布，还能在Web上维护文献目录。想一下一个实验室维护一个文献目录多方便啊，师弟们想找某方面的文献上Web就行了，连前人的评论和注释都有。中文期刊搜索结果导入Biblioscape的filter以及将IeeEexplore搜索结果导入Biblioscape的方法网上都有，实在找不到，微信后台留言。顺便说下，这个软件升级太慢了，对中文支持不太好。
10.Readcube
一款不错的pdf阅读器和文献管理器，原谅我把他阅读功能放在第一位。说下优点，界面好看(小编是颜控);可以看引用数量;搜索下载功能内置了Google Scholar 和PubMed搜索功能。此外还有一个功能就是根据你自己创建的文献数据库相关推荐，这个推荐还是不错的。不过Readcube云同步功能是要收费的，而且很多功能是墙外的，咳咳，你懂的。
11.Quosa
国内关注不多，是一款比较有个性全文分析软件，可以自动下载全文，并对全文进行分析，还可以提取已下载的pdf 中的引文信息。能够追踪新文献、目录可导入Endnote、能进行全文文献分析等功能。
12.Reference Manager
中文支持性奇差，不能忍。
13.NoteFirst
网络版文献管理软件是新一代的文献管理软件，全面支持SCI、EI、PUBMed、知网、万方等收录期刊所要求的双语参考文献自动形成等功能，用户可在不同电脑中导入导出个人文献数据库。NoteFirst可在万方、知网、ScienceDirect、IEEE等主流数据库检索的文献信息可用IE插件一键导入，用户可免费下载，基本功能使用免费，但高级功能需要购买开通。国内某些奇葩的期刊要求参考文献使用双语，也就是列出中文参考文献的同时，同步给出文中参考文献的英语翻译，还会有缺页提醒，这一点Notefrist绝对很赞。喜欢他的还是它提供多种实验记录的模板和范例，这一点还是很好玩的。
14.新科学
网址：http://www.xinkexue.com/home.php
基于网络的文献管理与分享平台，理念是以文会友。不错的尝试，由几位热血青年创立。现在是一站式服务，感觉挺有新意。
关于文献管理软件，试用了这么多，觉得使用之前一定要明白自己用它来做什么：管理文献，写论文插入参考文献，阅读文献，文献推送……或许一款文献管理软件并不能满足我们所有要求，为什么不试着使用多种哪?
软件各有取舍，小编仅仅起到抛砖引玉所用。无论哪一个软件都有自己存在的价值，也都有自己的优点。
15.Papers 3
网址：https://www.readcube.com/papers/
Mac平台专业的文献管理工具，这个软件大的好处就是简单易用。初次使用时可以选择导入硬盘上所有的PDF文献，或者选择新建图书馆，以后再手动挑选希望导入的PDF文献。使用pubmed搜索文献 ，直接检索和存档的PDF格式的文件，从您的个人科学图书馆内部文件阅读和研究他们，以方便你写论文 。Papers把文献有关的各项活动流畅的组织在一起。主要功能包括包文献导入、组织、阅读(注释)、自动匹配参考条目、搜索、在文档中插入引用、评点交流等。
